不少人认为芍药中开白花者就是白芍，开红花者就是赤芍。李时珍在这方面也有误解，他在《本草纲目》中说：“根之赤白，随花之色也”，从其之说者，以讹传讹，造成后世不少人的错误认识。

白芍为毛茛科芍药属植物（栽培种）的根，也即古人所说之金芍药。其为多年生草本，茎直立，高约一米，叶互生、呈卵圆形或椭圆形，具长柄；花甚大，单生于花茎分枝的顶端，约有十瓣，其花色有红、粉红和白色数种；根肥大，通常呈圆柱形或略呈纺锤形。

赤芍多指同科同属植物（野生种）草芍药、川赤芍等的根，即古人所言之木芍药类也。草芍药又名野芍药、山芍药。茎直立，高约四十至七十厘米。叶互生，呈倒卵形。花瓣六至八瓣，呈白色或淡红色，有芳香。川赤芍，又名毛果赤芍，茎高五十至八十厘米。叶有深裂。花顶生，通常七瓣，有红白两种。

综上所述，无论栽培品芍药、野生品草芍药，川赤芍，其花色均有红白两种，所以说白芍、赤芍并非以花之颜色而分。

近代，药用的白芍、赤芍不单是从植物品种上来区分，主要是加工方法不同。家种者，其根肥大平直，经沸水中煮后除去外皮或刮去外皮煮沸，再行整修晒干为白芍。野生者其根多瘦小而多筋，不经煮沸，直接晒干的为赤芍。但野生芍药中较粗壮的直条也有加工作为白芍的。反之，栽培品之瘦小不够白芍规格者，则不煮沸，晒干而又可作为赤芍应用。

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